Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CASP8-208ENST00000392266 1283 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ST13P2-201ENST00000438916 1109 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP003385.2-201ENST00000524910 973 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 C11orf70-205ENST00000534360 520 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms