Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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