Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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