Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP15Q9Y4E8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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