Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HECTD4Q9Y4D8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HECTD4Q9Y4D8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HECTD4Q9Y4D8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HECTD4Q9Y4D8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HECTD4Q9Y4D8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HECTD4Q9Y4D8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HECTD4Q9Y4D8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HECTD4Q9Y4D8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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