Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms