Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms