Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHANK2Q9UPX8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms