Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms