Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH13Q9UKX3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms