Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms