Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms