Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms