Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms