Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms