Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMMDC1Q9NPL8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms