Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NGRNQ9NPE2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms