Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAVER2Q9HCJ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAVER2Q9HCJ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms