Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms