Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9J2

MRPL44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL44Q9H9J2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL44Q9H9J2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms