Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKRIP1Q9H875 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms