Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms