Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms