Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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HOXD1Q9GZZ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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