Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BARHL1Q9BZE3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms