Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms