Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms