Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARP6Q9BRS8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms