Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms