Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms