Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms