Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMTK3Q96Q04 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms