Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI9

AGBL1, Cytosolic carboxypeptidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL1Q96MI9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGBL1Q96MI9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms