Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms