Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms