Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHACTR3Q96KR7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms