Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms