Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNRQ92752 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNRQ92752 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNRQ92752 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNRQ92752 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNRQ92752 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNRQ92752 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNRQ92752 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNRQ92752 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNRQ92752 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TNRQ92752 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TNRQ92752 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNRQ92752 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNRQ92752 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNRQ92752 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNRQ92752 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNRQ92752 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNRQ92752 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNRQ92752 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TNRQ92752 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TNRQ92752 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNRQ92752 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNRQ92752 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNRQ92752 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNRQ92752 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TNRQ92752 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNRQ92752 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNRQ92752 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNRQ92752 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms