Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms