Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms