Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF1Q8N6C5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF1Q8N6C5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms