Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms