Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms