Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
STAG2Q8N3U4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms