Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC80Q76M96 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms