Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C9orf139Q6ZV77 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C9orf139Q6ZV77 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms