Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms