Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms