Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms