Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms